查干沟村地处恩格贝镇南部，东与呼斯图村相连，南与哈拉汉村相邻,西与茶窑沟村接壤，北部与牛场梁村毗邻，距离政府所在地72公里，地形为丘陵山区（俗称梁外）。

查干沟村曾为松林地带，这里曾经有蒙古族和汉人居住，但蒙古族人较多，其名为蒙语，汉译为白沟，汉族人则多称为昌汉沟，2006年查干沟村与黑赖庙合并。黑赖庙则因当地有一座庙而得名，但在1946年，这座庙被日本人所炸毁。抗日战争时期，国民党部队曾在查干沟村王有塔地区设立司令部，共产党队伍也曾在此地长期驻扎，是抗日战争的重要地带。